拟南芥六个新的small RNAs 的克隆和功能预测

Plant Diversity ›› 2008, Vol. 30 ›› Issue (05): 570-576.

拟南芥六个新的small RNAs 的克隆和功能预测

唐霏^{1 , 2} , 梁岗^{1 , 2}, 余迪求¹

1 中国科学院西双版纳热带植物园, 云南昆明 650223 ; 2 中国科学院研究生院, 北京 100049

收稿日期:2008-01-09 出版日期:2008-10-25 发布日期:2008-10-25

Clone and Function Prediction of Six Novel Small RNAs in Arabidopsis (Cruciferae)

TANG Fei^{1, 2} , LIANG Gang^{1 , 2}, YU Di-Qiu1

1 Xishuangbanna Tropical Botanical Garden , Chinese Academy of Sciences, Kunming 650223 , China;
2 Graduate University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049 , China

Received:2008-01-09 Online:2008-10-25 Published:2008-10-25

摘要/Abstract

摘要： 以模式植物拟南芥为例, 建立了一种克隆small RNA 分子的技术平台, 为今后开展small RNA 分子的生物学功能研究提供技术支撑。通过用抗病信号分子水杨酸(SA) 处理拟南芥叶片后, 进行small RNA 分子群体的分离与接头连接、PCR 扩增、T - 载体克隆与检测、测序分析和生物信息学分析等一系列实验, 成功地克隆了一些small RNAs, 并对其表达和功能进行了分析。

关键词: 拟南芥, small RNA, PCR, 克隆

Abstract: We have developed a reproducible method of small RNAs cloning from model plant Arabidopsis thaliana , which will facilitate the research on small RNAs in the future .We have successfully cloned several small RNAs from leaves of Arabidopsis treated by SA ( signal molecule of disease resistance ) , using isolation , adapter ligation , PCR amplification , Tclone, sequence and bio-information analysis and so on . Furthermore , we conducted analysis on their expression profiles and predicted functions of these small RNAs .

Key words: Arabidopsis

中图分类号:

Q 943

唐霏1 , 2 , 梁岗1 , 2 , 余迪求1 . 拟南芥六个新的small RNAs 的克隆和功能预测[J]. Plant Diversity, 2008, 30(05): 570-576.

TANG Fei^, , LIANG Gang^,, YU Di-Qiu. Clone and Function Prediction of Six Novel Small RNAs in Arabidopsis (Cruciferae)[J]. Plant Diversity, 2008, 30(05): 570-576.

[1]	孙旭东1、2. 拟南芥Rboh基因家族成员的分子和功能学比较[J]. Plant Diversity, 2015, 37(4): 463-471.
[2]	齐靖, 董祯, 张玉星. 鸭梨ＡＣＣ氧化酶基因ｃＤＮＡ片段的克隆及农杆菌介导的反义遗传转化[J]. Plant Diversity, 2014, 36(05): 622-628.
[3]	李春, 李云驹, Mortimer Peter E., 许建初. 昆阳磷矿不同植被恢复模式对土壤理化性质和细菌群落的影响[J]. Plant Diversity, 2014, 36(04): 514-522.
[4]	徐放, 赵舒, 邬荣领, 杜芳. 一种优化的胡杨高效多重 (12重) SSR体系[J]. Plant Diversity, 2014, 36(03): 365-374.
[5]	陈卫民1、2、3, 柴红梅1、2、3, 张小雷1、2、3, 李树红1、2、3, 赵永昌1、2、3 . 杨柳田头菇B交配型基因信息素受体片段的克隆与分析[J]. Plant Diversity, 2012, 34(5): 519-524.
[6]	李婉莎, 王春涛, 胡向阳. 拟南芥叶边缘锯齿状突变体的分离与鉴定[J]. Plant Diversity, 2012, 34(01): 28-32.
[7]	郭涛1, 李婉莎2, 查向东1. 拟南芥光形态突变体的筛选与基因鉴定[J]. Plant Diversity, 2011, 33(6): 645-652.
[8]	曹志林1,2, 林冠男1, 丁文庆1, 杨仲南1, 崔永兰1 . 拟南芥黄化突变体chlm-4的基因定位与分析[J]. Plant Diversity, 2010, 32(02): 134-140.
[9]	季红春1,2，苏智先1,2, 杨军1，边春象1，胡进耀2，齐刚2 . 珙桐中一个与低温相关基因的克隆及其表达研究[J]. Plant Diversity, 2010, 32(02): 151-157.
[10]	关艳龙1，李婉莎2，殷奎德1，杨永平2，胡向阳2 . 激活标签法构建拟南芥突变体库及其表型分析[J]. Plant Diversity, 2010, 32(01): 53-59.
[11]	陈露露1，翟羽佳1，王鹏1，王晖1,2，郝家胜1,2，朱国萍1,2 . 茶树胞质型苹果酸脱氢酶的原核表达及生物信息学分析[J]. Plant Diversity, 2010, 32(01): 32-40.
[12]	陈悦1 , 2 , 许大全1 . 饱和白光引起的光系统II 捕光复合体(LHCII ) 从反应中心复合体脱离不同于弱红光引起的状态1 向状态2 的转换[J]. Plant Diversity, 2009, 31(1): 67-74.
[13]	高东, 王云月, 何霞红, 李成云, 朱有勇 . TaqMan 荧光定量RT-PCR 检测水稻RAc1基因mRNA 方法的建立 [J]. Plant Diversity, 2009, 31(1): 75-81.
[14]	刘润华1 , 2 , 江文波1 , 2 , 余迪求1 . 拟南芥神经酰胺酶基因对氧化胁迫的响应[J]. Plant Diversity, 2009, 31(04): 326-334.
[15]	刘冬梅1 , 2 , 杨凤玺1 , 2 , 余迪求1 . 高表达miR396 小分子导致拟南芥花柱头弯曲[J]. Plant Diversity, 2009, 31(04): 353-356.